Publication
このページでは、Neuliteとbionetliteに関する主要な論文を紹介します。
主要論文
1 Kuriyama, R.*, Akira, K.*, Green, L., Herrera, B., Dai, K., Iura, M., Gouaillardet, G., Terasawa, A., Kobayashi, T., Igarashi, Jun., Arkhipov, A., & Yamazaki, T. (2025). Microscopic-Level Mouse Whole Cortex Simulation Composed of 9 Million Biophysical Neurons and 26 Billion Synapses on the Supercomputer Fugaku. In Proceedings of the International Conference for High Performance Computing, Networking, Storage and Analysis (SC '25), November 16–21, 2025, St Louis, MO, USA. ACM, New York, NY, USA, 11 pages.
* 共同第一著者
論文の概要
この論文では、スーパーコンピュータ「富岳」を使用して、マウス全皮質の顕微鏡レベルでのシミュレーションを実現した研究を報告しています。
主な成果
900万個の生物物理学的ニューロン を含むマウス全皮質モデル
2600億個のシナプス による複雑な接続構造
「富岳」での効率的な並列実行
Perisomatic model を用いた詳細な生物物理学的シミュレーション
技術的貢献
bionetlite: BMTKを拡張したネットワーク構築フレームワーク
Neulite: 軽量で高性能な生物物理学的ニューロンシミュレータ
最適化技術: SVE（Scalable Vector Extensions）を活用したSIMD計算